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Una de las actividades fundamentales de la SECEM es la realización, cada dos años, de un congreso sobre conservación y estudio de mamíferos.
Desde que comenzaran en 1993 en Mollina (Málaga), estas reuniones se han consolidado como la plataforma más importante desde la que exponer y debatir la situación, en la Península Ibérica, de las distintas especies o grupos de mamíferos. Se estructuran en torno a conferencias invitadas y comunicaciones orales y paneles presentados por los asistentes. También se celebran reuniones de los grupos de trabajo, coloquios, exposiciones y otras actividades paralelas. Su objetivo es doble, por un lado, dar a conocer los resultados más recientes de la investigación desarrollados por los asistentes. Por otro, favorecer el desarrollo y gestión de actividades y proyectos relacionados con la conservación de los mamíferos. El XVI congreso de la SECEM se celebrará en Granollers (Barcelona), del 6 al 9 de diciembre de 2023. Más información en https://www.congresosecem.es/.